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免疫檢查點阻斷(ICB)、個性化腫瘤疫苗和溶瘤病毒療法等免疫療法的出現是抗腫瘤治療史上的一個里程碑。不幸的是，免疫治療只對有限的癌症型別有效，患者很可能在短時間內產生耐藥性。最近的研究表明，在大多數實體癌中，高的腫瘤突變負荷不能作為預測ICB應答的精確生物標誌物。因此，需要免疫治療結果的預測性生物標誌物。然而，對於免疫治療如何改變免疫微環境，以及它如何透過腫瘤-非腫瘤細胞相互作用發揮作用，我們知之甚少。腫瘤浸潤性淋巴細胞(TILs)是腫瘤微環境(tumormicroenvironment，TME)的重要組成部分，影響預後和臨床特徵，在腫瘤免疫治療中發揮基礎性作用。因此，對TILs進行全面、動態的監測有助於進一步探索腫瘤免疫治療的邊界。

測序技術為細胞生物學、疾病病原學和藥物反應提供了新的見解。批次測序研究以整個腫瘤為靶點，分析腫瘤內細胞的平均基因表達。然而，反映TME潛在異質性和可塑性的特定功能亞群可能被忽視。腫瘤主要由腫瘤細胞、間質細胞和免疫細胞組成，這些細胞可分為不同的亞型。這些細胞構成了腫瘤異質性，在腫瘤進展中起主要作用。scRNA-seq的存在可以透過分析和量化單個細胞的整個轉錄組來探索腫瘤異質性。對於單個細胞，其遺傳學和表觀遺傳學被揭示來預測其在癌症中的作用和對治療的反應。此外，基於單個細胞的空間轉錄揭示了單個細胞在原始腫瘤中的空間位置和細胞間通訊的區域性網路。

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